瀬織津姫を巡るミステリーの核心には、古代出雲や物部氏の影、そして謎多き太陽神との関わりが存在します。古史古伝『ホツマツタヱ』などを研究する在野の歴史家や民俗学者の間では、彼女は単なる祓い神ではなく、日本書紀が成立する以前の「原初の最高神」の一角であったと論じられてきました。
とりわけ重要なのが、瀬織津姫と饒速日命（ニギハヤヒノミコト）の関係です。大和朝廷以前に畿内を治めていたとされる物部氏の祖神・饒速日命は、天火明命（アメノホアカリ）とも同一視される太陽の男神です。民俗学的な伝承や神社誌の記録を紐解くと、饒速日命と瀬織津姫は「天と地」「太陽と水」「男神と女神」の対を成す夫婦神（原初の陰陽統合の象徴）として祀られていた痕跡が日本各地に点在しています。
さらに議論を呼んでいるのが、瀬織津姫と天照大神の同一人物説、あるいは「天照大神の荒魂（あらみたま）」説です。伊勢神宮の内宮・荒祭宮（あらまつりのみや）に祀られる天照大神荒魂の正体こそが瀬織津姫であるとする説は、神道界でも古くから神道家や国学者の間で囁かれてきました。天照大神が元来は男神であり、その正妃こそが瀬織津姫であったという仮説や、あるいは持統天皇の意向によって男神から女神へと再編された際に、本来の女神であった瀬織津姫の神格が荒魂として隔離されたという説など、諸説が百出しています。
この古代の神話的力学は、現代のスピリチュアル言説における「封印された真実の自分を取り戻す」というテーマと完全に連動しています。歴史の闇に葬られた女神の復権を追体験することが、自らの失われたアイデンティティを回復するプロセスとして捉えられているのです。
