情報が錯綜しやすいネット空間において、本作の結末に関して流布しているいくつかの「誤解」を是正しておく必要があります。
誤解1：アニメ最終回でハルヒと環は破局・失恋した？
アニメ第26話の後夜祭で環とハルヒが手を取り合うシーンを見て、「結局付き合っていない＝失恋エンドなのか」と早合点する視聴者が散見されます。しかしこれは明白な誤解です。前述の通り、アニメ版はあえて明確な恋人宣言をせず、「互いにとってかけがえのない唯一無二の存在であること」を確かめ合った状態にとどめたに過ぎません。物語の未来へ向けた前向きな余白を残した演出です。
誤解2：ハルヒはボストン留学で環と遠距離恋愛になった？
「ボストン留学＝離れ離れの遠距離恋愛」という認識も不正確です。環はハルヒに黙って同じアパートの隣室を契約し、実質的な生活圏を共にしています。自立した個人の領域を尊重しながらも、物理的な距離を作らないという、環ならではの奇想天外かつ深い愛情表現による解決が図られました。
誤解3：PS2ゲーム版の「光エンド」は公式の正史なのか？
2007年にアイディアファクトリー（オトメイト）から発売されたPlayStation 2用ソフト『桜蘭高校ホスト部』では、プレイヤーの選択肢によって常陸院光と結ばれる「光エンド」や鏡夜エンドなどが存在します。これらはあくまでゲーム独自のIFストーリー（マルチエンディング）であり、葉鳥ビスコ氏による原作の正史はあくまで「環とハルヒの結婚」です。
